一、你们与村委会签订的建设工程施工合同是有效的，因行政行为认定建筑物属于违建而停建，导致施工合同目的不能实现，这属于情势变更，你们可以主张解除合同，并按合同约定支付工程进度款，或主张相当于工程进度款的经济损失赔偿。法院通常会调解处理，尽量让施工方的经济损失降至最少。

二、至于合同约定的20%违约金，因政策原因导致项目停建，难以认定为发包方违约，因此若主张违约金是难以得到支持的。

有书面合同约定的，首先按照合同的具体约定处理。一方违约，另一方可以追究其违约责任。

可以要求甲方赔偿，因项目属于违建是甲方的过错，造成合同无法履行无法继续施工。属于违约，你方可以要求赔偿损失。

你要求的赔偿是合同约定的工程款的20%。前提是合同被依法认定为是有效成立的，是合法的，在这种情形下，法院才会支持你的赔偿请求。但在目前的司法实践中，对于该类合同的认定并没有统一的标准。有的法院认定该合同违反了法律的效力性强制规定而无效，如此情形下你的赔偿请求不会得到法院认可。但有的法院认定其合同仅仅是违反法律的管理性强制性规定，并非无效合同，在此情形下，你的赔偿请求可以得到支持。如行政机关认定该建筑物属于违建，系因为未缴纳相应的土地出让金，此时合同不应被认定无效，此障碍随时可以被清除，如此情形下，你的赔偿请求应该得到支持。