父亲过世将房产赠与给儿子，双方签署过房产赠与协议，但没有在相关部门公证过，只有村委会盖章，但是因为是安置房，父亲过世才交房，然后父亲的女儿回来争遗产，但父亲已经签署了赠与协议，办房产证的时候，房产部门说一定要女儿同意签字或者公证过的赠与协议才可以给办房产证，请问合法吗？需要怎么处理？